--6年前,中国成为了dna测序的全球领导者。 许多得益于华大基因( bgi )企业的贡献,位于深圳的华大基因企业已经购买了128台世界最快测序设备,企业的dna分析能力已经超过了世界的50%,bgi组成了非常年轻的生物新闻学者团队,同时与世界的研究者合作,
6年后,企业的状况完全不同了。 企业最著名的科学家和前瞻型领袖王俊去年7月离开华大基因,为企业带来主导地位的机器也过时了。 去年11月,企业要开发的工业规模的全部DNA测序设备也面临障碍,企业不得不裁员美国的子公司。 然后是竞争系统—illumina企业的x系列( illumina'; s x系列) )持续畅销,加快了全球序列的速度,降低了序列的价格。
配备最新的测序仪后,bgi的同行竞争对手逐渐出现。 最引人注目的同行竞争对手是由bgi前副总经理李瑞强创立的在北京设立的诺沃格内( novogene )企业。 目前,bgi已经不能再具有在测序行业没有竞争力的特征,但公司仍然宣称拥有世界上最快的测序能力和对科学的强烈野心。 其中包括对百万、百万和百万微生物群落系统的基因组进行测序。 现在,中国成为测序力量重新开始的诞生地。
测序巨头bgi的科学家们正在将遗传专业信息转化为医学行业的sim chi yin/vii
市场主导往往是数十亿美元的市场,今年3月中国已经公布了15年的精准医疗计划,该计划将与美国进行的类似计划形成竞争关系。 如果研究者们的这些努力能够实现他们的目标,将来医生们可以利用个人的基因组和生理学特征与个人的疾病进行比较,筛选出最佳的治疗方法,目前测序企业的目的是将大量的基因组数据转化为医疗福利。
要做到这一点,光靠测序的数据是不够的。 中国的一些企业开始强力测序以明确饮食等生活习惯因子的重要性,这有助于他们在了解个人疾病风险的同时寻找新的治疗方法。 药明康德wuxinextcode企业运营总监兼联合创始人hannes smarason表示:“与美国相比,中国有许多精准的医学研究项目。”
设备的兴起
序列背后的新能源要归功于illumina公司的一台叫做 hiseq x ten的机器。 这台机器之所以这样命名,是因为有10台hiseq x测序仪作为平台系统出售,如果运行10台机器,每年将测序18,000个以上的基因组。 年推出这套测序系统后,人类基因组测序花费了近1,000美元,给许多与bgi竞争的企业带来了机遇和希望。
并且,诺禾原为初创企业,遵循与bgi相似的模式,创始人李瑞强曾组成强大的生物新闻学者研究小组,专门进行测序和序列数据的解读分解,作为对金丝猴、棉花、其他植物和动物的合作基础研究项目的一部分 利用同一台机器,药明康德企业和云健康基因科技企业等其他企业着眼于为制药和个人基因组学企业提供测序服务。
目前测序服务领域的增长正处于加速阶段,诺禾致源于今年4月购买了第二套x ten系统。 据云健康总裁金刚博士介绍,企业今年又增加了两套测序系统,截至今年年底,中国至少拥有70台测序仪,截至去年年底,illumina企业已在全球销售300台测序仪。
bgi企业一直在努力跟上测序的步伐。 年在加利福尼亚州山景 视图]收购了complete genomics企业,目的是创建并同时销售可在内部采用的先进测序仪。 bgi企业称这个超级测序仪为revolocity去年11月,在销售了3个订单后,revolocity的销售突然停止,目前bgi为上一代illumina企业的128台hiseq 2000测序仪,
目前中国在世界上的测序份额为20 %~30 %,即使在bgi全盛时期依然很低,但预计中国测序未来的增长将很快。 dnanexus企业行政总裁richard daly表示:“测序能力的快速增长无处不在,与世界其他地方相比,中国的增长率非常快。”
当然,bgi企业还有另一招。 bgiseq-500是它们设计的实验室桌面工具,其设计也基于complete genomics的技术,并且今年bgiseq-500已经开始陆续生产发货。 华大基因全球研发负责人何亦武表示,使用该系统进行人类基因组测序需要1000美元,且其规模小、易于采用,能够满足我国目前兴起的临床序列诉求。 他大胆预测,未来几年企业将把人类DNA测序价格降至200美元,目前中国是进行生物医学研究最令人兴奋的地方。
基因组整体化( genomes en masse )
精确医学计划的出台将通过中国测序巨头激起兴奋的波澜,用于技术改进、测序和数据共享、分解的钱将超过百万人的基因组研究、新型药物和诊断技术的开发、个性化医学服务的消费; 在金钱利益的驱使下,医院和临床医生们开始与测序企业合作。
将百万人基因组计划研究会分为多项研究,该研究包括代谢性疾病、乳腺癌、肠道癌和其他情况的患者等5万人,也有代表中国北部、中部、南部同龄群体的研究对象,研究人员的目的是注意不同亚群患者的不同遗传背景。 其他国家也在研究类似的研究计划。 例如,在英国进行的10万个基因组测序研究,以及在美国消耗2亿100万个基因组的相关研究等。
注意者表示,中国在这方面具有一定的特点,这不仅是企业获得政府大力支持的原因,在未来五年,政府希望在国家医疗保险目录中增加更多精准药物和分子诊断产品,以确保企业研究价格能够回收,在美国,开发新产品的生物技术企业享有保险
9月,华大基因企业将开启中国基因库。 位于深圳的这个占地5公顷的设备站,收藏了数百万来自人类、动物、植物、微生物的样本数据。 中国政府将这个样本库委托给华大基因,这个样本库可以向全世界的科学家提供可用的样本和数据以供研究。 目前,华大基因企业自身也已经拥有包含100万个基因组的数据库,这在某种程度上与国家项目重叠的daly说,我们也将迅速达到这种程度。 因为现在我们和政府、医院、大学建立了合作关系。 因为我们有自己的测序仪。 那是因为我们有信心超越其他研究团体。
华大基因前首席执行官王俊博士表示,深入了解100万人机体的基因组是一个非常重大的挑战。 目前,王俊博士在深圳成立了碳云智能科技有限企业,企业计划收集100多万人的测序数据和其他生物新闻,如生物蛋白质和代谢物水平的变化情况、脑图像结果、生物图像监测生物葡萄糖水平,并 他称之为“数字化的你”( digital form of you ) )。 目前,他计划利用人工智能整合所有数据,提供可以比较个人基因和生理状态的医疗护理战略。 不到一年,王俊已经吸引了一亿美元的投资,其中包括腾讯公司。 这是
目前,中国正在积极探索基因组学如何惠及人类健康的3月份,华大基因企业进行了第100万个一致性检测。 这项检查主要有助于检查母亲血液中循环的胎儿dna,以检测胎儿染色体异常等。 例如唐氏症; 中国现行的第二子生育许可政策也认为这样的检查诉求可以加速。当然,进行癌症遗传特征检查也将很快步入正轨; 云健康企业去年向中国100多家基因企业提供了1.5万份肿瘤样本的基因组数据,帮助后期诊断疾病和选择患者最佳化疗药物,高价基因检测市场与国家中产阶级一致; 目前,在中国收入在5万美元以上的人约有1亿人(中高收入群体)。
对王俊来说,测序研究不过是一顶旧帽子,基因组学更重要,但他说,这只是谜团之一,是所有多而杂的形式,所有神经变性障碍、癌症和糖尿病的发病都远远超过了遗传学所能理解的。 谈及基因组学,没有临床新闻的大量数据似乎明显不够。
标题:“中国:一个超级dna测序大国 如今将转战精准医学研究行业”
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